مدرسه علمیه میرزاجعفر در جوار حرم مطهر رضوی، موقوفه‌ای با دیرینگی نزدیک به ۴۰۰ سال است که در طول چهار قرن اخیر کانون آموزش علوم دینی و اسلامی بوده است که همچنان به عنوان میراث درخشانی از وقف درخشش دارد.