براساس اساسنامه دانشگاه علوم اسلامي رضوي مصوب سيصد و شصت و ششمين جلسه شوراي عالي انقلاب فرهنگي مورخ 5/10/74، هيئت امناي دانشگاه يكي از اركان دانشگاه محسوب مي شود كه اعضاي آن توسط توليت عظماي آستان قدس رضوي و مؤسس محترم دانشگاه تعيين مي شود.
در حال حاضر اعضاي هيئت امناي دانشگاه كه متشكل از اساتيد حوزه و دانشگاه مي باشند به شرح ذيل مي باشند:

1. حضرت آيت الله واعظ طبسي مؤسس محترم دانشگاه و توليت عظماي آستان قدس رضوي

2. آيت الله محمد واعظ زاده خراساني؛ استاد دانشگاه فردوسي مشهد

3. حجت الاسلام و المسلمين محمدباقر فرزانه؛ رئيس دانشگاه علوم اسلامي رضوي

4. حجت الاسلام والمسلمين محمد سيد آبادي؛ استاد حوزه علميه مشهد

5. حجت الاسلام و المسلمين علي اكبر الهي خراساني؛ استاد حوزه و دانشگاه

6. حجت الاسلام و المسلمين سيد مصباح عاملي؛ استاد حوزه و دانشگاه

7. حجت الاسلام و المسلمين اكبر فرجام؛ استاد حوزه و دانشگاه

8. حجت الاسلام و المسلمين علي خياط؛ استاد حوزه و دانشگاه

9. دكتر علي¬محمد برادران رفيعي؛ استاد دانشگاه فردوسي

10. دكتر سيد احمد علوي؛ مدرس دانشگاه و قائم مقام توليت آستان قدس رضوي

11. حجت الاسلام والمسلمين محمد هادي عبد خدايي؛ استاد حوزه و دانشگاه

12. حجت الاسلام و المسلمين علي واعظ طبسي؛ استاد حوزه و دانشگاه

13. حجت الاسلام و المسلمين سيداحمد علم الهدي؛ استاد حوزه و دانشگاه و امام جمعه مشهد مقدس